På baggrund af en vurdering af klientens ubevidste angstkanalisering, giver ISTDP mulighed for at bestemme, hvorvidt og i hvilken grad kognitive og perceptuelle symptomer som tankeforstyrrelser, koncentrationsforstyrrelser, let–afledelighed, lys og lyd–overfølsomhed, auditive, visuelle og somatiske hallucinationer er relateret til underliggende emotionelle konflikter og evt. tidligere traumer.

ISTDP giver endvidere udøveren mulighed for at vurdere den emotionelle baggrund for patienters somatiseringstilstande samt foretage en systematisk sandsynlighedsvurdering af, hvorvidt disse kan ændres ved hjælp af metoden.

ISTDP bygger i overensstemmelse med nyere neuropsykologisk forskning på en teori om psykopatologi, hvor årsagen til symptomernes udvikling og vedligeholdelse skal findes i klientens ubevidste emotionsregulering. I ISTDP behandling er målet derfor ikke alene, at klienten bliver i stand til kognitivt at identificere sine følelser men ydermere at registrere og rumme disse følelsers fysisk/kropslige komponenter og adfærdsmæssige impulser. For at opnå dette mål, må klienten lære at genkende sine automatiske forsvarsmekanismer og disses negative indflydelse på klientens symptom niveau og livsudfoldelse. Gennem identifikation og styrkelse af klientens sunde ego, arbejdes der i ISTDP på at etablere en samarbejdsalliance mellem terapeuten og klientens sunde ego, hvorved klienten vender sig mod egne forsvarsmekanismer og gradvist begynder at styrke sine ego-adaptive funktioner gennem den terapeutiske behandling.